Amprentele se formează în uter, atunci când stratul bazal al pielii crește mai repede decât straturile de deasupra și dedesubt, subliniind-o și provocând o încrețire. Variațiile de spirale, arce și bucle sunt unice pentru fiecare individ și sunt reținute pe tot parcursul vieții. Oamenii de știință cred că genele joacă un rol, dar modelele exacte ale amprentelor digitale nu sunt împărtășite chiar de gemeni identici.
Originea amprentelor digitale se află într-un strat de piele între epidermă și dermă, cunoscut sub numele de strat bazal. Deoarece celulele care compun stratul bazal sunt sub epidermă, leziunile superficiale nu tind să schimbe amprentele digitale.
Pielea de pe palmele mâinilor și tălpile picioarelor este cunoscută sub numele de piele groasă și are o serie de diferențe de la piele la restul corpului. Epiderma este mai groasă în aceste locuri, deși pielea este mai groasă în altă parte. Grosimea pielii nu are foliculi de păr, dar are mai multe glande sudoripare decât în alte părți. Oamenii au observat tiparele de amprente ale amprentelor digitale și unicitatea lor față de indivizi, pentru o lungă perioadă de timp. Numai în anii relativi, totuși, oamenii au studiat amprentele digitale și utilizările lor în identificare.