Cromatografia este utilizată pentru a studia pigmentul plantei prin extragerea pigmenților din plantă și apoi sortarea acestora prin caracteristicile lor fizice astfel încât să poată fi analizate. Cromatografia este utilă pentru separarea diferitelor tipuri de pigmenți de plante, deoarece acestea sunt foarte asemănătoare unul cu altul și poate fi dificil de deosebit sau de separat fizic altfel.
Cromatografia este o metodă prin care elementele individuale ale unei singure substanțe sau obiecte sunt separate una de cealaltă pentru a fi studiate individual. Această sarcină este adesea complicată de faptul că anumite bucăți dintr-o celulă, cum ar fi pigmentul din celulele plantelor, pot fi dificil de diferențiat chimic. Pentru a separa elementele unei substanțe ne-gazoase, oamenii de știință de obicei trec substanța printr-un amestec de soluții. Multe laboratoare biochimice de astăzi au o mașină, numită cromatograf, în mod special în acest scop.
Atunci când o celulă de plantă este trecută printr-o soluție, pigmenți diferiți se vor lega de diferite părți ale soluției. Prin controlul soluțiilor folosite, oamenii de știință pot separa pigmenții unul de celălalt unul câte unul, formând diferite inele de culoare. Aceste inele reprezintă fiecare un tip diferit de pigment în celula plantei și fiecare are propriile caracteristici fizice. Chiar dacă sunt similare din punct de vedere chimic, acest lucru separă pigmenții și le permite biochimilor să le studieze.