Pigmenții auxiliari sunt pigmenți din frunze de plante, alții decât clorofila, care ajută la procesul de fotosinteză. Pigmenții de accesorii funcționează prin extinderea gamei de lungimi de undă a luminii pe care o instalație le absoarbe. Pigmenții de accesorii conferă plantelor culori unice.
Clorofila a este pigmentul primar de absorbție a luminii în frunzele plantelor. Acesta absoarbe lungimi de undă luminoase în gama roșie și albastră și reflectă undele verzi, care conferă celor mai multe frunze culoarea lor verde distinctă. Diferiții pigmenți auxiliari absoarbe diferite lungimi de undă de lumină. Carotenoizii, cei mai obișnuiți pigmenți auxiliari, absorb lungimile de undă extra albastre. Pe lângă faptul că ajută la crearea energiei din fotosinteză, carotenoizii protejează de asemenea clorofila a de daunele provocate de prea multă radiație luminoasă. Clorofila b, c și d, licopenul și fibrobiloproteinele sunt pigmenți auxiliari adiționali găsiți în unele plante.
Algele și cianobacteriile, un organism cu o singură celulă care trăiește în apă și folosește fotosinteza, conține multe pigmenți auxiliari pentru a maximiza producția de energie în habitatele lor de apă. Phycobiliproteinele permit acestor organisme de apă să absoarbă cele mai multe lungimi de undă de lumină, incluzând o mare parte a intervalului verde. Multe specii de alge și alte plante de apă au culori roșii sau galbene, datorită pigmenților lor auxiliari unici, care absoarbe lungimile de undă ale luminii care călătoresc cel mai bine prin apă. Pigmenții auxiliari specifici găsiți într-o instalație de apă ajută oamenii de știință să determine caracteristicile ecosistemului natural al plantei.