În timp ce calcarul în sine nu afectează mediul, mineritul de calcar poate avea un impact negativ. Pe de altă parte, mediul poate afecta calcarul rupându-l.
Exploatările de calcar pot polua apa și pot crea zăcăminte. Când calcarul se dizolvă în timp ce se află încă în pământ, se formează peșteri și vâlcuri, un fenomen natural cunoscut drept carst. Deși acest lucru nu afectează mediul în forma sa naturală, odată ce va fi extrasă calcarul, gropile pot forma și perturba căile navigabile subterane. Aceasta schimbă masa naturală a apei. Procesul de minerit actual modifică, de asemenea, căile navigabile existente, adăugând apă suplimentară fluxurilor și altor corpuri de apă care nu numai că inundă zona înconjurătoare, ci adaugă și poluanți. În același timp, atrage apa de la alte caracteristici, cum ar fi lacurile și iazurile.
Limestonul poate fi deteriorat de mediul înconjurător prin eroziunea apei și a vremii. Piatra absoarbe apă care poate cauza deteriorarea acesteia în timp. Dacă apa are un conținut ridicat de aciditate, deteriorarea este mai rapidă. Vântul poate purta detalii de piatră. Limestonul este, de asemenea, predispus la decolorare prin expunerea la ulei, coloranți sau chiar material organic, cum ar fi îngrășăminte de pasăre sau descompunerea materiei vegetale. Poate chiar să obțină pete de rugină dacă este expus la fierul oxidant.