Majoritatea ciupercilor obțin energia prin absorbția materiei organice vii sau moarte prin rețelele lor hifale. Ciupercile sunt capabile să absoarbă substanțe nutritive din mai multe substraturi diferite, inclusiv amoniac, etanol, acetat și nitrat. Câteva specii de fungi folosesc melanina pigmentară pentru a extrage energia din radiațiile ionizante.
Ciupercile cresc pe alimentele pe care le supun. Acest lucru le permite să absoarbă materialul vegetal sau animal prin membranele și hifele. Ciupercile sunt capabile doar să absoarbă substanțe nutritive simple care se dizolvă în apă, cum ar fi zahărul. Pentru a utiliza substanțe nutritive complexe pentru a crea energie, ciupercile elimină enzimele digestive, care rup materialul complex în jos, simplificându-l astfel încât să poată fi consumat.
Ciupercile cresc de obicei pe un material organic bogat în nutrienți, cum ar fi plante sau animale moarte sau vii. Hifele sunt baza fungiilor și sunt folosite în multe scopuri, inclusiv transformarea nutrienților în energie. Unele specii de ciuperci folosesc hifele pentru a prăji prada și apoi pentru a-și absorbi lichidele.
Unele specii de ciuperci au relații simbiotice cu plantele. Ciupercile ajută planta să prelucreze metalele și alte materiale complexe, oferind de asemenea plantei substanțe nutritive valoroase, cum ar fi fosforul. La randul sau, planta furnizeaza ciupercile cu nutrientii necesari pentru a face energie. Alte specii de ciuperci sunt vânători și își folosesc hifele pentru a prinde creaturi mici, cum ar fi nematozi sau protozoare.