Proteinele care se deplasează de la reticulul endoplasmatic la aparatul Golgi se deplasează în interiorul vehiculelor de transport acoperite cu COPII. Conform celei de-a patra ediții a Molecular Biology of the Cell de pe site-ul NCBI, veziculele de transport sunt spulberate dintr-o regiune a reticulului endoplasmatic cunoscut sub numele de zone de ieșire ER. Aceste locuri de ieșire nu au ribozomi legați de membrană care altfel ar întârzia procesul.
Proteinele de marfă selectate gravitează spre veziculele de transport, unde devin în cele din urmă concentrate. Oamenii de stiinta cred ca aceste proteine de marfa au un semnal de iesire care alerteaza proteine complementare ale receptorilor la prezenta coajei COPII in vezicula invechita. Acest lucru ajută proteinele complementare să se mute în vezicul. Cu toate acestea, unele proteine fără semnale de ieșire, care rămân de obicei în ER, sunt, de asemenea, ambalate în vezicule învechite pentru a se deplasa în aparatul Golgi. Aproximativ 200 de proteine membranare, adesea de diferite tipuri, sunt conținute în vezicul de transport mediu de 50 nanometri.
Cu toate acestea, nu toate proteinele necesită o veziculă. Atunci când proteinele secretorii sunt produse în concentrații foarte mari, unele dintre ele se scurg din ER fără ajutorul receptorilor de sortare. Alte proteine, pe de altă parte, nu au voie să plece deloc. De exemplu, atunci când proteinele sunt dezvelite sau desfundate greșit, acestea sunt reținute în ER într-o proteină chaperone.
