Rasa cu care este amestecat un Chihuahua este necunoscut. Există multe idei cu privire la originea rasei, dar nu există nici o dovadă că acestea sunt adevărate.
Unii cred că rasa a venit din regiunea Sud și America Centrală și a fost dezvoltată prin creșterea câinelui Techichi. Alții cred că Chihuahua provine din China și a fost importat în Statele Unite unde a fost crescut cu câini nativi mai mici. Încă alții cred că rasa a fost derivată din vulpea Fennec, originară din Africa de Sud.
Chiar și cu dovezi că Chihuahuas au fost în jurul din timpuri străvechi, se spune că au provenit din Mexic și este numit pentru statul Chihuahua situat în această țară.