Hipopotamul pitic este clasificat ca vegetarian. Acest animal nu numai că mănâncă iarbă și lăstari, dar consumă și ferigi, ierburi, plante semiacvatice și fructe. Interesant este că hipopotamul cu piramide are un stomac cu mai multe camere, ca o vacă. Cu toate acestea, sistemul său digestiv nu funcționează la fel ca sistemul digestiv al vacilor sau al altor rumegătoare.
Hipopotamurile se hrănesc noaptea. Hipopotamul iese din corpul său obișnuit de apă pentru a mânca, dar întotdeauna încearcă să rămână cât mai aproape de casă. Cu toate acestea, în cazul în care alimentele sunt rare, este capabil să călătorească câteva mile pentru a găsi o altă sursă de hrană. Hipopotamul își folosește buzele largi pentru a rupe ierburile și pentru a le înmuia înainte de înghițire; nu mesteca cu dintii. Deoarece ierburile și alte astfel de vegetație au un conținut scăzut de nutrienți, hipopotamul trebuie să mănânce mult pentru a primi o cantitate bună de nutriție. Hipopotamii au știut să mănânce aproape 90 de kilograme de mâncare în fiecare noapte.