Mulți botanici folosesc instrumente cum ar fi lupa, camerele de luat vederi, dispozitivele GPS, ghidurile de teren și computerele. În plus, un simplu notebook și un creion sunt instrumente de neprețuit, care permit biologilor din teren să-și înregistreze observațiile. Botanicii folosesc o varietate de instrumente diferite, în funcție de specialitatea lor și de sarcina specifică pe care încearcă să o realizeze.
Unii botaniști lucrează în laboratoare cu unelte și echipamente extrem de avansate. De exemplu, botanicii care încearcă să investigheze structura ADN sau microscopică a unei plante pot necesita microscoape și alte echipamente de laborator de înaltă tehnologie. Alți botanici lucrează în sere, studiind obiceiurile de creștere și cerințele nutritive ale plantelor. Acești oameni de știință trebuie să utilizeze higrometre, kituri de testare a solului și alte dispozitive de măsurare. Învățătorii cu orientare academică, în special cei care se concentrează asupra studierii taxonomiei sau sistematice, își petrec cea mai mare parte a timpului folosind computerele și cărțile de consultanță pentru a-și termina munca.
Pruners, foarfece și cuțite sunt folosite de botanici cu o varietate de specialități, în special în rândul celor care lucrează în domeniu. Unii botanisti folosesc un instrument numit hori-hori pentru a sapa radacinile unor mici plante erbacee. Containerele și pungile de colectare sunt utile pentru transportul probelor înapoi la laborator pentru o analiză mai detaliată. Plăcile de plante sunt, de asemenea, unelte utile care permit botanistilor să păstreze frunzele pentru studii viitoare.
