Deoarece nu au deschideri separate pentru reproducere și excreție, deschiderea intestinală posterioară în sistemele excretoare de rechini este numită mai degrabă cloaca decât un anus. În sistemele digestive ale rechinilor, alimentele trec printr-un singur intestin scurt și apoi sunt expulzate prin cloaca.
La rechini, mâncarea trece mai întâi prin esofag, unde extensiile asemănătoare cu degetele împiedică scăparea alimentelor. Stomacurile de rechini sunt în formă de J și reprezintă aproximativ 20% din lungimea lor. Pereții musculare ai stomacului au celule care produc acid clorhidric care înmoaie și dizolvă osul și mucus pentru a proteja mucoasa stomacală. Inele de mușchi pe pereții stomacului fac peristaltism pentru a amesteca și descompune produsele alimentare. Intestinul este locul de absorbție a nutrienților. La om, intestinele scurte și lungi combinate măsoară aproximativ 28 de picioare, în timp ce intestinul unui rechin este de numai un pic lung, dar mult mai amplu. Intestinul unui rechin funcționează foarte încet pentru a digera alimentele. Oamenii ar putea să anuleze alimente doar la 4 ore după ce au mâncat, dar în cazul rechinilor, procesul ar putea dura 16-17 ore.
O altă metodă pe care un rechin o folosește pentru a elimina deșeurile este transformarea stomacului în interior. Când are în stomac materia indigestibilă, își scoate stomacul din interior prin gură, clătește stomacul cu apă de mare și o retrage în poziția sa normală.
