Un fenotip intermediar descrie un organism care afișează un amestec al trasaturilor fenotipice exprimate de părinții săi. Dacă o floare roșie polenizează o floare albă și descendența rezultată este roz, descendența descrisă ca fenotip intermediar. Fenotipurile intermediare apar atunci când trăsăturile sub control nu sunt nici dominante, nici recesive.
Fenotipurile intermediare sunt destul de comune în lumea vie. Majoritatea oamenilor exprimă un fenotip care este intermediar de la părinți în multe feluri. Cu toate acestea, organismele care posedă fenotipuri intermediare pot prezenta, de asemenea, trăsături dominante sau recesive. De exemplu, doi copii umani pot prezenta simultan trăsături dominante sau recesive și cele ale unui fenotip intermediar. Culoarea ochilor copiilor este în mare parte rezultatul unor gene dominante și recesive. Dimpotrivă, înălțimea, greutatea, culoarea părului, inteligența și multe alte trăsături ale copiilor sunt, în general, exemple de fenotipuri intermediare.
Un organism poartă instrucțiunile genetice pentru construcția sa în ADN-ul celulelor sale. Acest cod genetic este numit genotipul organismului. Acest cod instruiește celulele organismului să construiască o colecție de proteine. În plus, codul genetic îi spune corpului organismului cum să aranjeze proteinele. Structura fizică care rezultă din genotipul organismului se numește fenotipul acestuia.