Celulele eucariote au organele, structuri legate de membrană care îndeplinesc diferite funcții în celulă, iar celulele procariote nu. Unele organele tipice eucariote includ nucleul, mitocondriile, ribozomii, aparatele Golgi și cloroplastele.
Celulele eucariote sunt mai organizate și mai complexe decât celulele procariote. ADN-ul ADN este găzduit în nucleu, în timp ce ADN-ul procariotic plutește liber în citoplasmă.
În 1970, dr. Lynn Margulis a susținut că organelele celulelor eucariote au fost la un moment dat procariote care au fost înghițite de celule mai mari. Celulele mai mari au devenit gazde, protejând celulele mai mici, în timp ce celulele mai mici asigurau alimente gazelor lor. În timp, nici nu putea exista fără cealaltă. Această teorie endosimbiotică a fost susținută de dovezile că organele precum mitocondriile și cloroplastele seamănă cu bacteriile moderne.
