Coreea de Sud găzduiește o mare varietate de mamifere și păsări native. Unele dintre acestea, cum ar fi bătălia de baical pe cale de dispariție, trăiesc în principal în biomele locale, în timp ce altele, vizitați sezonul în apele din apropierea Coreei de Sud.
Baleliile sunt unii dintre cei mai spectaculoși vizitatori din Coreea de Sud. Specii de balene care pot fi găsite la câțiva kilometri de coastă sunt cocoșul, sperma și balenele gri. În interiorul țării, Coreea de Sud are pești râuri și lacuri, dintre care unii nu trăiesc în altă parte pe Pământ. Printre acestia se numara burta Somjiny, bullhead-ul coreean stufos, mai multe specii de loach si shinerul negru.
Coreea de Sud are patru specii native de salamandru, în special salamandrul coreean. Această specie este neobișnuită în a fi singura specie salamandră fără plămâni cunoscută ca fiind endemică în Asia. Adulții respiră direct prin piele, nu cu plămâni, așa cum face salamandrul coreean cu clești.
Șoarecele de câmp cu dungi este comun pentru Asia de Est, dar Coreea de Sud are o varianta proprie, șoarecele de câmp Jeju, pe care unii naturaliști au sugerat că ar trebui clasificați ca specii proprii. Coreea de Sud are, de asemenea, un număr de nevertebrate native, inclusiv un katydid (Sphagniana monticola), o molie (Pyrausta nigrimaculata) și un gândac de mare (Demonax seoulensis).