Câteva dintre microorganismele cele mai dăunătoare omului sunt Staphylococcus aureus, Escheria coli, Enterococcus faecium și Pseudomonas aeruginosa. Microorganismele care provoacă boala sunt denumite agenți patogeni.
Toate bacteriile, majoritatea protozoarelor și unele ciuperci sunt microorganisme. Termenul "microorganisme" este folosit pentru a indica o formă de viață care nu este vizibilă pentru ochiul uman fără ajutorul unui microscop. Acestea pot fi o singură celulă sau sunt alcătuite din mai multe celule. Există microorganisme în orice tip de mediu de pe Pământ, dar există mai multe microorganisme benefice decât cele dăunătoare. Ingineria genetică implică manipularea microorganismelor pentru a crea caracteristici specifice în organismele mai mari.