Fiecare aminoacid este format din trei coduri triplet de bază numite codoni. Codonii sunt realizați din trei combinații de patru nucleotide disponibile. Există 64 de combinații potențiale de codoni.
Codurile care sunt folosite determină tipul de aminoacid creat. Ordinea codonilor din secvența tripletă determină care este proteina creată. Șaizeci și una din cele 64 de combinații creează aminoacizii în proteine. Combinațiile rămase creează secvențele de terminare sau stopare ale lanțului. Codonii multipli, numiți codoni sinonime, pot codifica același aminoacid. Atunci când codonii sinonimi sunt prezenți într-un lanț, lanțul este declarat a fi degenerat.