Nonpathogenii sunt de obicei microbi inofensivi care locuiesc intr-un organism viu, cum ar fi Staphylococcus aureus si candida. Unii microbi nepatogeni sunt bacterii care pot fi benefic pentru organismul uman, cum ar fi bacteriile cu acid lactic. Majoritatea bacteriilor nepatogene, lactococilor și bacteriilor din acidul lactic provin din alimente, cum ar fi produsele lactate, carnea și unele legume. Acestea sunt, de asemenea, cunoscute ca bacterii gram-pozitive și probiotice.
Agenții patogeni, pe de altă parte, sunt bacterii, germeni, paraziți și viruși care provoacă infecții și boli. Cu toate acestea, de la sfârșitul secolului al XIX-lea, a existat o dezbatere despre cât de inofensiv sunt microbii non-patogeni. Potrivit BMC Biology, același microb poate exista în stări patogene și nepatogene. La un individ cu un sistem imunitar deficitar, un microb nepatogen poate deveni un agent patogen oportunist, activând genele proaste ale microbilor care pot provoca apoi boli grave.Din 2014, oamenii de stiinta continua sa cerceteze cauzele care pot face un nonpathogen sa devina un microb patogen. Microbii patogeni se dezvoltă adesea pentru a deveni rezistenți la antibiotice. Potrivit BMC, antibioticele si chirurgia fac ca individul sa fie mai vulnerabil si poate declansa dezvoltarea unui microb patogen care provoaca infectii sau boli. Stafilococul este un microb care devine deseori un agent patogen care provoacă infecții dobândite în spital.
