L. acidophilus este cea mai frecvent folosită bacterie bună. Există în intestine și asistă la procesul de digestie prin producerea de peroxid de hidrogen și acid lactic, prevenind creșterea bacteriilor dăunătoare. L. acidophilus se găsește în iaurtul probiotic.
Bifidobacterium bifidum este o bacterie bună care poate ajuta la vindecarea unui ulcer gastric provocat de un tip rău de bacterii numită Helicobacter pylori. Se poate ameliora, de asemenea, sindromul intestinului iritabil, infecțiile drojdie și eczema atopică. Streptococcus thermophilus este o bacterie bună care poate ajuta la ameliorarea simptomelor asociate cu intoleranța la lactoză, cum ar fi greața, cramperea și diareea. Bacillus coagulans este o bacterie bună care poate ajuta la problemele gastro-intestinale și pentru a preveni infecțiile respiratorii.Bacteriile incorecte, cum ar fi salmonella, Clostridium perfringens, listeria monocytogenes și staphyloccus aureusis, sunt principalele cauze ale decesului, spitalizării și bolii în Statele Unite. Escherichia coli este un tip de bacterii care poate fi bun sau rău. Se găsește în intestine, dar unele componente pot provoca boli grave, infecții ale tractului urinar și diaree.