Unele dintre dezavantajele călătoriilor spațiale includ NASA cheltuind bani pe proiecte atunci când nu știe cât de multe investiții comerciale se pot baza, există riscuri pentru siguranța umană cu fiecare misiune și anumite orbite sunt foarte lente. În plus, modificările aduse finanțării pentru călătorii în spațiu pot face dificil pentru studenți să devină astronauti.
Deși NASA se află acum în parteneriat cu firme private pentru finanțarea călătoriilor spațiale, nu există nicio garanție că firmele private pot investi. În timp ce mulți manifestă un interes, acest lucru poate însemna că NASA începe să lucreze la proiecte care sunt lăsate fără finanțare comercială. Dacă doar un număr mic de firme private arată o investiție, stabilirea contractelor devine ineficientă. În plus, călătoriile în spațiu sunt nesigure, cu tragedii istorice, inclusiv pierderea lui Challenger în 1986 și Columbia în 2003. Alte pierderi ar putea fi dăunătoare în ceea ce privește viața umană și reputația călătoriilor spațiale, ceea ce duce la reglementări restrictive.
Din punct de vedere logistic, unele aspecte ale călătoriei în spațiu sunt provocatoare. Deoarece navele pot transporta numai cantități limitate de combustibil, ele se bazează pe orbite planetare și forțe gravitaționale pentru a îndeplini misiunile. Aceste transferuri limitează, de asemenea, numărul de lansări pe care o navă le poate face. De exemplu, transferul Earth-Mars este disponibil numai o dată la 2 ani, iar transferul Pământ-Jupiter este disponibil o dată la 13 luni. Ambele sunt lente.
Odată cu guvernul federal transferând finanțarea programelor spațiale către surse private, există mai puține șanse ca studenții să devină astronauti. De obicei, aceștia intră în program după o carieră în forțele aeriene, însă finanțarea federală mai puțin înseamnă șanse reduse de acest lucru.