Cele două aplicații practice pentru hârtie de cromatografie se află în analiza substanțelor colorate și a cantităților mici de amestecuri. Anchetatorii legitimi îl folosesc pentru a identifica componentele în amestecuri de vopsele și amestecuri de medicamente.
Pigmenții coloranți de plante și culorile alimentare artificiale sunt analizate utilizând cromatografia pe hârtie de către chimiști. În medicina legală, componentele medicamentelor care variază de la aspirină la narcotice în probele de sânge și urină sunt determinate prin utilizarea acesteia. Un eșantion de vopsea auto poate fi analizat pentru a determina de la care vehicul a venit, modelul vehiculului și anul de fabricație. În cazul falsificării sau al falsificării, eșantionul de cerneală poate fi analizat pentru a determina ce stil a provenit și tipul de cerneală utilizat.
Cromatografia înseamnă scrierea în culori. Este o tehnică comună folosită pentru separarea ionilor sau a moleculelor în funcție de compoziția și interacțiunile lor în timpul etapelor de papetărie și mobilă. Un preparat de testare care conține eșantionul de separat se aplică pe hârtia de cromatografie. Hârtia este apoi pusă într-un container cu marginea sa atingând o soluție specifică în recipient. Aceasta se numește "faza de papetărie". Datorită acțiunii capilare, soluția deplasează hârtia, cunoscută sub denumirea de "fază mobilă". Când soluția ajunge pe fața de probă sau linia de pe hârtie, moleculele sau ionii din probă se deplasează în sus pe hârtie împreună cu soluția. Viteza ionilor sau a moleculelor depinde de solubilitatea lor în soluție. Cu cat sunt mai solubili, cu atat se misca mai repede. Aceasta duce la formarea unei cromatograme sau a unei hârtii cu diferite pete de ioni sau molecule segregate.