Câteva exemple de bacterii aerobe includ Mycobacterium tuberculosis, care provoacă tuberculoză, bacterii din genul Nocardia care provoacă nocardioză și Psuedomonas aeruginosa, care cauzează pneumonie, infecții ale tractului urinar și probleme gastro-intestinale. bacteriile au metabolism pe bază de oxigen și nu pot supraviețui fără oxigen.
Bacteriile anaerobe nu necesită oxigen. Diferențele dintre bacteriile anaerobe și cele aerobe pot fi observate atunci când sunt plasate într-un mediu de cultură. Bacteriile aerobe se colectează la suprafața mediului lichid astfel încât să fie expuse la cantitatea maximă de oxigen. Unele bacterii pot folosi, dar nu au nevoie de oxigen; alte tipuri nu pot supraviețui în prezența oxigenului liber.