Organismele clasificate ca arheebacterii au pereți celulari, conțin acizi grași, au ARN polimerază complexă și au sisteme de metabolizare. Aceste caracteristici disting arheebacteriile de alte organisme. Unele trăsături sunt totuși împărtășite cu organisme din alte regate, inclusiv Eucariote și Bacterii.
Toate arheebacteriile au pereți celulari, dar structura pereților variază în funcție de specie. Arheebacteriile nu dispun de peptidoglican, care le distinge de organismele strâns legate de bacteriile regatului. Arheebacteriile au lipide membranare compuse din acizi grași și au polimerază ARN complexă pentru a transcrie și copia șabloanele ADN în produsele ARN. Archae digera, de asemenea, folosind un sistem de metabolism intern, care are loc în mai multe etape.
