Flagella ajută corpurile celulare, cum ar fi sperma și bacteriile, să treacă prin lichid. Flagella, ca și cilia, sunt compuse din microtubuli care sunt conectați la membrana plasmatică.
Microtubulii dintr-un flagel sunt grupați în nouă perechi care înconjoară o pereche de microtubuli. Miscarea flagelui este rezultatul microtubulelor care se aliniaza reciproc. Fiul, situat la capătul flagelului, este atașat de cârlig și este compus din flagelină. Mișcarea filamentului depinde de mișcarea motorului care este conectat la cârlig. Corpul sau motorul bazal, care este produs de centrioli, se poate deplasa cu o viteză de 300 de rotații pe secundă.În bacterii, flagelul permite corpului bacterian să se deplaseze în sus sau în jos într-o linie dreaptă și să schimbe direcția. Corpul bazal care se atașează la corpul celular afectează dispunerea structurii filamentului. Filamentul este în formă elicoidală, dar proteinele de flagelină se rearanjează dacă cuplul sau motorul sunt aplicate sau îndepărtate. Unele corpuri celulare cu flagelă sunt capabile să treacă prin țesuturi, creând probleme pentru sistemul limfatic sau circulator. Flagella sunt adesea găsite individual sau în număr mic, în timp ce multe cilia sunt găsite împreună.
