Sistemul excretor elimină substanțele potențial toxice care se acumulează din procesele metabolice. La mamifere, organele primare utilizate pentru filtrarea sângelui exceselor de substanțe chimice, în special a deșeurilor cu azot, sunt rinichii. Alte organe implicate includ uretele care transportă urină în vezică, care depozitează deșeurile până când ele pot fi excretate prin uretra.
La mamifere, urina este utilizată pentru a colecta deșeuri de azot sub formă de acid uric sau, ca și la om, uree. Ureea este o substanță chimică solubilă în apă, astfel încât organismul poate folosi cu ușurință excesul de apă pentru a scăpa de ea. Acidul uric, pe de altă parte, nu este solubil în apă și este excretat ca un solid după specii, cum ar fi păsările cu puțină apă. Acest lucru este, de asemenea, folosit de multe specii în zonele cu climă aridă în care utilizarea apei pentru excreție ar fi prea risipă.Cantitățile foarte mari de apă și substanțe chimice sunt luate de rinichi, dar o mare majoritate este returnată sângelui. Rinichii sunt cel puțin la fel de necesari pentru reglarea echilibrului fluidelor în organism, deoarece sunt pentru eliminarea deșeurilor. Alte organe implicate în sistemul excretor includ ficatul și pielea, care îndepărtează unele substanțe toxice și deșeuri prin transpirație.
