Funcția cisternei terminale este de a acționa ca un sit de stocare a calciului. În contracția musculară, calciul stocat în cisternele terminale este esențial pentru buna funcționare. Acest sit de stocare a calciului utilizat pentru contracția musculară nu este același cu cel utilizat pentru țesutul osos.
În mușchiul scheletic, două cisterne terminale se îmbină cu un tub T pentru a forma o structură de triadă. Când se stimulează un mușchi, calciul este eliberat din unitatea de stocare a cisternei terminale. Acest tip de calciu se leagă cu troponina-C în sarcoplasm pentru a executa contracția musculară.
Rolul calciului ca activator al contracției musculare a fost descoperit în timpul experimentelor din secolul XX pe țesutul broască.