Deși atât Fâșia Gaza cât și Cisiordania fac parte din Teritoriile Palestiniene, ei au relații diferite cu Israelul. Începând cu anul 2015, guvernul din Fâșia Gaza se opune Israelului, în timp ce guvernul din Cisiordania își acceptă existența.
Deși acordurile de la Oslo au impus ca Teritoriile Palestiniene să fie tratate ca o unitate, separarea geografică a celor două teritorii le-a făcut ușor guvernelor să meargă în direcții diferite. Hamas, o organizație radicală, este la putere în Fâșia Gaza, începând din 2015. Hamas nu recunoaște Israelul ca țară legitimă și este în conflict cu guvernul israelian. La rândul său, Israelul nu recunoaște că Hamas este un guvern legitim. Fâșia Gaza găzduiește un număr mare de refugiați palestinieni, iar locuitorii sunt împiedicați să călătorească în restul țării, cu excepția unor motive umanitare, cum ar fi tratamentul medical.
În schimb, Fatah, partea responsabilă din Cisiordania, acceptă existența Israelului și are o relație diplomatică cu el. Cisiordania este, de asemenea, mai laică decât Fâșia Gaza, care urmează unei culturi islamice mai stricte. Datorită relației sale prietene cu Israelul, locuitorii din Cisiordania au mai multe libertăți decât omologii lor din Gaza. Cisiordania are, de asemenea, o economie mai bună și este mai puțin dependentă de ajutorul străin decât Gaza.