Diferența dintre anafază 1 și anafază 2 este separarea diferitelor tipuri de cromozomi. În Anaphaza 1 a mitozei, cromozomii omologi (identici) separați de fiecare parte a celulei și centromere este intreg. În Anaphaza 2, cromatidele sora se separă, iar centromerele sunt împărțite, ceea ce determină separarea cromatidelor.
În anafază 1, cromozomii omologi se mișcă la polii opuși, iar cromatidele sora rămân atașate. Există și alte modificări: microtubulele kinetochore (axele) se scurtează pentru a trage cromozomii spre poli. Acest lucru formează două seturi haploid, ceea ce înseamnă că fiecare set are 23 de cromozomi sau 46 totali, numărul care se găsește de obicei la om. Fiecare cromozom conține două cromotide care se mișcă separat în anafază 2.
În anafa 2, centrometrele sunt despicate în mijloc, permițând microtubulii să se atașeze la kinetochorii care trag cromatidele sora în afară. Centromerele reprezintă partea centrală a cromatidelor surori care le rețin, adesea reprezentate de un punct sau de un cerc. Când acest lucru este rupt, cele două separate. Cromatidele sora sunt acum numite cromozomi sora atunci când se deplasează spre stâlpii opuși și nu mai sunt împreună. În acest moment, celula este aproape gata să se separe complet în celule fiice, rezultând patru celule fiice generale până la sfârșitul meiozei 2.