Religia predominantă a coloniilor din New England a fost creștinismul, dar pe linii diferite față de Biserica Anglicană (sau Biserica Angliei) pe care coloniștii au fugit. Abordarea Puritanului față de creștinism a fost la distanță practicile lor de la catolicism, o sarcină pe care o considera că anglicanismul nu a reușit. Mai exact, ei au respins structura episcopală (ierarhică) a Bisericii Anglicane, cu rangul ei de vicar, episcop și arhiepiscop, și a căutat în schimb să pună în aplicare o structură congregațională, prin care fiecare biserică sau congregație să fie mai mult sau mai puțin independentă și autonomă .
Această structură congregațională permite bisericilor să-și aranjeze propriile impozite și să angajeze, precum și focul, propriii lor slujitori. Ei erau, de asemenea, extrem de selectivi pentru apartenența lor, în ciuda faptului că prezența bisericii era obligatorie. Standardele înalte ale Bisericii Puritane și-au făcut dificilă supraviețuirea prin generații și conducătorii bisericii au fost forțați să își înmoaie cerințele prin "Legământul de jumătate" din 1662. Acest lucru a permis copiilor botezați care au refuzat să dea mărturie că li se acordă calitatea de membru parțial , dar nu și de sfințenie, ceea ce le-ar fi permis să voteze asupra afacerilor bisericești și să ia comuniune.
Puritanii idealisti religioși erau de asemenea cunoscuți și ca non-separatiști pentru a le distinge de grupul mai extrem, deși mult mai mic, de reformatori biserici, cunoscuți sub numele de separatiști. Acest grup, probabil mai cunoscut sub numele de Pilgrims din Colonia Plymouth, a ajuns înaintea puritanilor, căutând o pauză mult mai puternică de la tradițiile bisericii anglicane.
