Antibioticele pot provoca un dezechilibru în producerea de estrogen și progesteron în organism, care, la rândul său, pot întârzia sau cauza un ciclu menstrual neregulat, afirmă Calculatorul ciclului menstrual. Antibioticele interferează de asemenea cu performanța metabolică a organismului și cu reglarea hormonilor, ceea ce poate reduce eficacitatea controlului nașterilor.
Deoarece antibioticele sunt absorbite prin ficat, în cazul în care estrogenul și progesteronul sunt metabolizate, rata de metabolizare a hormonilor va fi afectată, conform Calculatorului ciclului menstrual. Această schimbare a ratei metabolismului afectează cantitatea de estrogen din sânge, care poate provoca un ciclu neregulat, deoarece informațiile greșite sunt trimise către glanda hipofizară.