Formele aparțin regatului cunoscut sub numele de ciuperci. Această împărăție face parte din sistemul de clasificare a celor cinci regate introdus de R.H. Whittaker în 1959, care conferă plantelor un statut egal cu plantele și animalele. Formele, precum și alte ciuperci, sunt organisme eucariote care sunt considerate distincte de plante și animale.
În afară de apartenența la regnul ciuperci, mucegaiurile pot fi plasate în mai multe phyla de ciuperci, printre care se numără Zygomycota, Ascomycota, Oomycota, Basidiomycota și Chytridiomycota. Zygomycota conține o matriță găsită pe pâine cunoscută sub numele de Rhizopus stolonifera. Formele negre se găsesc în arborele Ascomycota. Oomyota conține matrițe de apă saprofite și mucegai albastru de tutun.
