Thomas Hunt Morgan a folosit muște de fructe pentru a studia genetica din mai multe motive. În primul rând, muștele de fructe au un ciclu de viață scurt, care durează în medie de doar 30 de zile. Aceasta înseamnă că trăsăturile genetice pot fi studiate în zeci de generații în decursul unui an. Acest ciclu de reproducere rapidă este imposibil de găsit în orice model de mamifere, chiar șoareci sau șobolani. În al doilea rând, zbura de fructe produce un număr mare de descendenți.
O muște de fructe de sex feminin poate pune până la 500 de ouă într-un singur lot. Deoarece muștele de fructe pot pune mai multe loturi de ouă într-o viață, acest lucru se ridică la 2 000 de copii sau mai mulți, mult mai mult decât orice mamă mamă ar putea produce. O a treia considerație este costul. Frunzele de colonii de fructe sunt extrem de ieftine pentru menținere. La un nivel minim, ele necesită o sursă de hrană, cum ar fi fructele pestele și un termostat reglabil. Interesant este că fructele zboară mai mult timp la temperaturi scăzute, dar cresc mai des la temperaturi de peste 86 grade Fahrenheit.
Avantajele suplimentare ale folosirii muștelor de fructe au devenit evidente cu trecerea timpului. Fluturile de fructe conțin patru perechi de cromozomi giganți, cunoscuți sub denumirea de cromozomi politeni, în glandele salivare. Aceste cromozomi sunt suficient de mari pentru a fi văzute sub un microscop luminos, tipul folosit în mod obișnuit la vremea respectivă. Această observație a furnizat dovezi solide că genele, unitățile fizice ale eredității, sunt situate pe cromozomi.
Morgan și studenții săi au descoperit, de asemenea, că multe gene care codifică trăsături, cum ar fi culoarea ochilor, forma aripilor și lungimea părului, au fost moștenite împreună în majoritatea descendenților. Ocazional, aceste grupuri de legare, așa cum le-a numit Morgan, au fost perturbate ca cromozomi de zbor amestecați și potrivite în timpul meiozei. Oamenii de știință se referă la aceste evenimente încrucișate cromozomiale drept recombinare. Acest proces este o sursă majoră de variație genetică la toate speciile care reproduc sexual.