Amenințările din trecut pentru balenele ucigașe includ captura pentru utilizare în exponatele acvariului și vânătoarea comercială. Deși puținele balene ucigătoare sunt vânate pentru valoarea lor comercială începând cu 2014, ele continuă să fie împușcate de către pescari comerciali, care le consideră competitori. De la deversarea de petrol Exxon Valdez în 1989, deversările de petrol și alte scurgeri de poluanți au fost considerate amenințări serioase pentru balenele ucigașe. Tulburările de zgomot care afectează balenele ucigașe includ sonarul naval de mare intensitate, pe care scanările CAT au dovedit că au cauzat hemoragii în jurul creierului și urechilor, precum și sunetul din fermele de foraj, transport și somon.
În 2013, Uniunea Internațională pentru Conservarea Naturii și a Resurselor Naturale Lista Roșie a speciilor amenințate enumeră unitatea taxonomică a balenelor ucigase ca deficiente de date. Anterior, balenele ucigașe au fost considerate o singură specie, dar cercetătorii susțin că pot exista mai multe specii de balene ucigașe, dintre care unele sunt puse în pericol începând din 2014. Bomboanele ucigașe rezidente se deplasează în păstăi și locuiesc în zone specifice, în timp ce balenele ucigașe tranzitorii se mișcă grupuri mai mici și se află în zone mai mari. De exemplu, balenele ucigase, de exemplu, un grup de trei păstăi mari care locuiesc în apele de coastă ale Statelor Unite și Canadei de Vest, au fost declarate ca fiind o specie pe cale de dispariție în conformitate cu Legea privind speciile pe cale de dispariție în 2005 și Administrația Națională Oceanică și Atmosferică un habitat critic supus conservării în 2006.
