Există multe teorii referitoare la motivul pentru care Anasazi a dispărut, dar nu există dovezi solide care să dau un motiv specific. În trecut era suspectat că seceta de la sfârșitul anilor 1200 a condus-o din casele lor vechi , dar mai multe descoperiri au arătat că acest lucru nu ar fi fost suficient pentru a le elimina.
Ideea că acești oameni au dispărut în totalitate este de asemenea un nume greșit. Indienii moderni Pueblo sunt descendenți direcți ai acestei rase de oameni, astfel încât nu au dispărut cu adevărat. Dovezile arată că Anasazi ar fi putut alege să plece datorită faptului că a fost împovărat în zonă de prea mult timp și terenul a fost folosit la limitele sale.