Safranin este utilizat ca colorant pentru textile și ca pete pentru diferite procedee științifice. Procedurile științifice care implică safranină includ contracepția Gram, contrastainingul endoscopic, detectarea granulelor și indicația redox.
Safranin este un colorant roșu, solubil în apă, denumit și fenosafranină, roșu de bază 2 și Safranin 0. Este capabil să coloreze toate nucleele de celule roșii. Safranin este disponibil sub formă de dimetil sau trimetil safranină, care sunt în principiu identice în comportament și aspect.
Safranin este utilizat în mod obișnuit în colorarea Gram, care ajută la distingerea grupurilor de bacterii Gram-pozitive și Gram-negative din cauza compoziției peretelui celular. Ambele grupuri sunt colorate mai întâi cu un colorant violet de cristal solubil în apă și iodul este adăugat la soluție. Se adaugă apoi alcool etilic sau acetonă, ceea ce determină ca bacteriile Gram-pozitive să rețină colorantul violet cristal și bacteriile Gram-negative pentru a elimina colorantul violet de cristal. Apoi, safraninul este adăugat ca un contrastain pentru bacterii, colorând bacteria gram-negativă roșie. Bacteriile gram-pozitive rămân violete. Pereții celulari ai bacteriilor Gram-pozitive conțin un strat gros de peptidoglican, care permite bacteriilor să rețină pata de cristal violet. Gram-negativ bacterii retine pata de safranin, mai degraba decat pete violet, datorita pereti lor cel mai subtire peptidoglycan.
