Toate calmarurile posedă cromatografe care se găsesc pe tot corpul lor. Aceste celule de schimbare a culorii permit calmarul să se camufleze cu mediul înconjurător. Împreună cu corpurile contra-umbrite, cu culoarea luminii de pe partea inferioară și colorarea mai închisă pe partea de sus, calmarurile se pot face practic invizibile în timp ce vânează și pradă pradă de pradă.
Unele calmaruri posedă fotofori, care sunt celule care produc lumină asupra corpului calmarului și care sunt folosite pentru a atrage colegii, pentru a descuraja pradă, pentru a oferi camuflaj și pentru a atrage prada. Activarea și modelarea acestor fotofori se realizează printr-un proces numit bioluminescență.
Excreția de cerneală este un alt mecanism important de apărare folosit de calmaruri. Adiacent la rectul unui calmar este sacul de cerneală, pe care animalul îl folosește pentru a elimina cerneala pentru a deruta sau a dezorienta în alt mod pe prădători și rivali.
În afară de a servi ca mecanism primar pentru prinderea și prinderea pradă, combinația de supt și cârligele ascuțite găsite pe cele două tentacule și opt brațe ale mai multor specii de calmar pot funcționa și ca mecanisme de apărare potențial letale.
