Locuind în cel mai rece loc din lume, un pinguin împărat are straturi de pene groase ca o primă linie de apărare. Cu excepția picioarelor și a părții inferioare a aripilor, pene de tip scară și impermeabilă acoperă întregul corp al pinguinului pentru a asigura izolarea și protecția împotriva vremii înghețate a Antarcticii.
Temperaturile din regiunea polară scad în timpul iernii, iar pinguinii împărați supraviețuiesc sezonului dur, aglomerându-se în grupuri mari, numite formări de broaște țestoase, pentru conservarea și împărțirea căldurii corporale. Temperatura poate ajunge până la 20 de grade în interiorul formării broaștelor. Spre deosebire de alte pinguini teritoriali, pinguinii împărți lucrează împreună ca grup. Când cei de la baza ghearei s-au încălzit, se mișcă pentru a permite păsărilor de pe marginea formațiunii să se mute în centru.
Prădătorii principali ai pinguinilor sunt sigiliile leopard și balenele ucigașe. Ei își folosesc picioarele și agilitatea pentru a înota rapid și a căuta terenul când sunt amenințați de balenele ucigașe. În general, evită sigilii de leopard și încearcă să rămână într-un grup pentru a evita să fie mâncați. Skuas, un tip de păsări de mare, se bucură de ouăle de pinguin și de păsările nou-născute. Pinguinii adulți protejează ouăle prin împăturirea lor sub picioarele lor sau prin crearea unui inel cu alți pinguini pentru a sta în pază în jurul ouălor și al celor tineri.
