Locomoția în regatul contrast este variată și extrem de versatilă. Amoebii folosesc procese citoplasmatice numite pseudopoduri, în timp ce parametia are rânduri de cilii care se mișcă la unison ca vâslele mici. Euglena și dinoflagellatele utilizează proteine asemănătoare cu biciul numite flagelă pentru a înota și unele protozoare, cum ar fi diatomele și plasmodiul (organismul care cauzează malarie), nu sunt motile, ceea ce înseamnă că nu se mișcă independent.
Cilia și flagelul prezintă o mare asemănare cu structurile observate în bacterii. Acest lucru sugerează că proteinele motorii au apărut foarte devreme în cursul evoluției. Alte eucariote, inclusiv oamenii, au păstrat aceste structuri utile. În tractul respirator uman, celulele epiteliale cilizate scot bacteriile din aer și resturile din căile respiratorii înapoi spre gât, unde reflexul tusei le scoate din corp. În ceea ce privește flagelul, sperma conține proteine similare în cozile lor care le permit să înoate.Pseudopodia ca mijloc de locomoție rămâne în mare parte limitată la amoeba; Cu toate acestea, câteva tipuri de celule umane păstrează această caracteristică. Celulele albe din globulele albe, numite macrofage, utilizează o structură similară cu cea a unui pseudopod pentru a înghiți bacteriile și sporii fungali. Megacariocitele (celule gigante din măduva osoasă) extind mai multe procese asemănătoare pseudopodului, apoi scapă fragmentele citoplasmatice pentru a forma trombocite.