Obiectul "Clue Jr: Cazul tortului dispărut" este de a naviga prin indicii pentru a identifica cine a mâncat tortul, când a fost consumat tortul și ce băutură a fost consumată cu tortul. Jocul este recomandat pentru doi sau șase jucători cu vârsta cuprinsă între 5 și 8 ani și constă din piloți de joc, pioni de caractere și mobilier, spinner, baze de jucători, cărți de mister și un jurnal de detectiv.
Jucătorii încep prin alegerea unei baze de mover sau a unui jucător și plasarea acesteia pe culoarea potrivită pe bordul jocului. Primul jucător învârte spinner-ul și înaintează numărul de spații afișate pe spinner. Dacă jucătorii aterizează într-un spațiu deja ocupat, spațiul este omis sau jucătorii pot alege să aștepte să privească în camera din tabla de joc. Când aterizați într-un spațiu adiacent unei camere, jucătorii pot debloca gaura de chei și pot descoperi indicii din cameră. Folosind notepad-ul detectiv, jucătorii ar trebui să scrie indicii și presupuneri în timp ce se deplasează în jurul tabloului de joc. Odată ce un jucător este gata să ghicească cine a mâncat tortul, unde a fost mâncat și ce băutură a fost consumată, acel jucător trebuie să anunțe presupunerea și primește o șansă de a vedea cartea de mister pentru a vedea dacă presupunerea este corectă. Dacă presupunerea este corectă, jucătorul câștigă jocul. Dacă nu, jucătorul trebuie să pună cartela înapoi, iar jocul se reia cu ceilalți jucători.