Un microscop electronic are o rezoluție mai mare decât un microscop luminos, ceea ce are ca rezultat detalii mai detaliate ale specimenului vizualizat. Deși un microscop electronic poate mări un eșantion de până la 2 milioane de ori, microscopul este avantajos atunci când vizualizați celulele vii.
Microscopia electronică utilizează mai degrabă un fascicul de electroni decât lumină pentru a obține o mărire. Pentru a face acest lucru, electronii trec printr-o bucată subțire a specimenului. Lungimile de undă ale unui fascicul de electroni sunt mult mai mici decât lumina, permițând o rezoluție mai bună. Datorită capacității sale de a ajunge la astfel de niveluri de rezoluție acută, este posibil să se vadă forma unui specimen. Deși detaliul finit este benefic în multe circumstanțe, specimenul văzut sub microscopul electronic trebuie să fie fixat în timpul pregătirii, astfel încât structura să nu fie perturbată, ceea ce înseamnă că specimenul nu va fi în viață și nu poate decât să-și respecte caracteristicile vizuale.
Funcțiile microscopice de lumină se bazează pe difracție. Pentru a obține o mărire, lumina trece prin sau reflectă un eșantion înainte de a fi transmis prin lentilele optice. În anumite condiții, celulele vii și funcțiile lor biologice, cum ar fi aportul alimentar și diviziunea celulară, pot fi văzute. Spectatorii pot urmări, de asemenea, proteinele și observă mișcarea celulelor.
