Anton van Leeuwenhoek a fost cel care a descoperit cilia și flagelul în 1676. Descoperirea a fost trimisă Societății Regale din Londra într-o scrisoare care descrie constatările sale ca un al doilea fel de animale, oval în formă cu picioare mici.
În acel moment, Cilia și flagella au fost descrise ca fiind ovale în formă și având picioare mici care se mișcau foarte înfrigurător. Cilia și flagelul sunt de fapt aceleași, conform NCBI, dar li s-au dat nume diferite cu mult înainte de stabilirea și revizuirea structurilor lor individuale.
De obicei, celulele au una sau două flageluri, dar celulele ciliate sunt descrise ca având multe cilia mici. De exemplu, o celulă poate avea o flagelă, două flageluri sau mii de cilia.Ambele cilia și flagelle sunt folosite pentru a călători și pentru a aduce particule de hrană. De asemenea, ele deplasează materialele de-a lungul suprafeței țesuturilor. De exemplu, oamenii au cilia în nas; aceste cilia acopera pasajele respiratorii si ajuta expulzarea si dislocarea particulelor care se colecteaza in interiorul secretiilor de mucus gasite in aceste pasaje.
Cilia și flagelul mișcă celulele prin bătăi, care pot muta celulele cu o viteză de 1 mm /s. Unele cilia și flagelle sunt la fel de mari ca și 2 mm în unele tipuri de spermă de insecte.