Formarea magnetitului în timpul metamorfismului geologic al calcarului apare numai cu calcarul care sa format înainte ca nivelurile de oxigen de pe Pământ să fie suficiente pentru a se acumula în ocean. Acest fier a atins niveluri în care se aglomera și se solidificase din apa oceanului, formând minereuri de fier pe podeaua mării. O parte din acest minereu de fier, când a suferit procese geologice care implică căldură și presiune, a devenit magnetit. Organismele fotosintetice au crescut foarte mult nivelurile de oxigen de pe Pământ, iar fierul nu mai persistă în oceane, deoarece este oxidat prea repede.
Magneitul este unul dintre puținele materiale magnetice care apar în mod natural și, pe măsură ce se formează, polii magnetici se aliniază cu cei ai Pământului. Odată format, totuși, alinierea magnetică magnetică nu se schimbă, chiar dacă se schimbă câmpul magnetic al Pământului. Această proprietate oferă oamenilor de știință o evidență a modului în care s-au comportat câmpurile magnetice ale Pământului întinzându-se înapoi cu miliarde de ani.