Există mai multe modalități de a număra coloniile de bacterii care cresc într-un vas Petri, de la contorizarea simplă manuală, până la mașini complexe concepute pentru măsurarea electronică a creșterii coloniei . În funcție de numărul de feluri de mâncare Petri și de frecvența măsurătorilor, utilizatorii diferiți vor beneficia de diferite metode de numărare.
Numărarea manuală este potrivită pentru majoritatea setărilor de laborator, deoarece singura resursă necesară este timpul. Este atât economic cât și ușor; orice persoană capabilă să numere și să înregistreze petele observate în vasul Petri este capabilă să numere colonii prin această metodă. Există câteva instrumente simple, inclusiv markere și contoare operate de clicuri manuale, care pot ajuta în procesul de înregistrare. Dezavantajul contorizării cu mâna este că este consumator de timp și poate fi predispus la erori umane.
Există mașini care au fost proiectate special pentru a măsura numărul de colonii prezente într-un vas Petri. Aceste mașini oferă utilizatorilor o ieșire care include numerele de numărare și creșterea pe o anumită perioadă de timp. Utilizarea mașinilor de numărare este utilă în mediul de laborator în care timpul este mai bine petrecut în alte activități decât numărarea manuală și unde precizia este extrem de importantă. Dezavantajele utilizării mașinilor de numărare includ cheltuieli și funcționalități potențial limitate ale dispozitivului, dincolo de scopuri simple de numărare.
