Cele mai multe Puritanii au vrut să purifice practicile bisericii anglicane, preferând să o reformeze din interior pentru a elimina toate vestigiile închinării catolice. Mulți dintre acești puritani au demarat colonia din Massachusetts Bay pentru a-și construi orașul pe un deal, o altă biserică pe care puritanii o pot vedea drept model. Cu toate acestea, pelerinii au determinat la sfârșitul secolului al XVI-lea că Biserica Anglicană a trecut dincolo de reformă. De aceea, ei s-au separat în întregime din Biserică, mulți dintre ei mutându-se în Olanda înainte de a emigra în coloniile americane.
Deși aceste diferențe par minore, a fost mai ușor pentru Puritanii din Massachusetts să obțină finanțare, aprobarea și protecția tronului britanic decât era pentru pelerini. În plus, Puritanii din Massachusetts au fost în general un grup mai educat și mai bogat decât pelerinii, care erau în mare parte artizani și agricultori. Acest lucru a condus, în timp, la o mai mare prosperitate și o creștere mult mai rapidă pentru zona Boston-Salem. În 1691, Colonia Plymouth încă mică a fuzionat cu Colonia Massachusetts Bay pentru a forma provincia Massachusetts Bay.
