Conform Enciclopediei Mondiale a Națiunilor, descoperitorul european al Filipinelor a fost Ferdinand Magellan. A descoperit Filipine pe 15 martie 1521. Dovada habitatelor umane ale insulelor datează din Cu 250.000 de ani în urmă.
Experții cred că Negritos a traversat poduri din Borneo și Sumatra în Filipine în urmă cu aproximativ 30.000 de ani. Malaysii erau mai târziu migranți din sud, depășind în cele din urmă Negriții. Traderii arabi au intrat în contact cu insulele filipineze din sudul secolului al XIV-lea. Magellan a încercat să revendice insulele pentru Spania după ce le-a descoperit în 1521, dar a fost ucis în luptă de căpitanul filipinez Lapulapu. Spania a lansat o invazie a insulelor în 1565.
