Procesul de sinapsis are loc în stadiul prozei I de meioză. În sinapsă, legătura omoloagă cromozomi reproduse, care devine cunoscută ca un tetrad. Crossover între două perechi de tetrads poate apărea în orice moment.
În timpul sinapsisului, cromozomii omologi încep cu capătul lor atașat la plicul nuclear. Cromozomii migrează apoi până când capetele de potrivire au fost asociate împreună. Piesa care conectează cromozomii după paring se numește complexul sinaptonemal, care este o structură de proteine. Această etapă este adesea confundată cu profaza care apare în mitoză, dar ele îndeplinesc diferite funcții și nu produc aceleași rezultate.