Septul interventricular împarte ventriculul din stânga din ventriculul drept, menținând astfel sângele oxigenat din amestec cu sângele deoxigenat. Fără această separare, organismul nu ar putea să obțină nivelul de oxigen necesar pentru subzistență. Septul contribuie, de asemenea, la forma și structura inimii.
În interiorul inimii, ventriculii sunt responsabili pentru aprovizionarea organismului cu sânge bogat în oxigen. Cel mai mare ventricul stâng pompe sânge la cea mai mare parte a corpului, în timp ce ventriculul drept trimite sânge la plămâni. Dacă sângele oxigenat din ventriculul stâng să se amestece cu sângele deoxigenat din ventriculul drept, integritatea și eficacitatea sistemului ar fi întrerupte, împiedicând organismul să primească o cantitate suficientă de oxigen.Septul îndeplinește rolul de a menține cele două ventricule separate. Este făcută în principal din mușchi groși. Este înclinat spre spate și spre dreapta. Curba sa dreaptă formează o porțiune a camerei ventriculului drept.
Partea superioară a septului separă vestibulul aortic de atriul drept. Această porțiune are o structură foarte fibroasă.
Defecțiunea septului ventricular este o tulburare caracterizată printr-o gaură în sept. Acesta apare cel mai frecvent la nou-născuți.