Sistemul de administrare al celulei este numit reticulul endoplasmatic. Această structură este un sistem de tuburi, saculete și membrane care pot fi interconectate. Reticulul endoplasmatic este continuu cu membrana nucleului, precum și cu membrana din jurul celulei.
Există două tipuri de reticulum endoplasmic într-o celulă: dur și neted. Ribozomii, structuri care fac proteine, se agață de reticulul endoplasmatic brut, conferindu-i un aspect ciudat. Reticulul endoplasmic brut, sau RER, constă în principal din sacuri tip disc. Reticulul endoplasmatic neted, sau SER, nu are ribozomi pe suprafața sa și este compus, în cea mai mare parte, din tubuli.
SER produce și transportă lipide sau grăsimi din celulă. RER transferă proteinele de la ribozomi către exteriorul celulei sau la o altă structură numită aparatul Golgi care urmează să fie prelucrată în continuare.