Reacția în lanț a polimerazei înfundată sau PCR nesupravegheat reprezintă o modificare a reacției standard în polimerază cu scopul de a reduce contaminarea. CLCSupport explică faptul că contaminarea are loc ca urmare a legării nespecificate în cadrul produselor .
O astfel de legare apare atunci când sunt amplificate site-urile de legare a primerului neașteptate. Acest lucru este numit drept eroare. Ideea din spatele cuiburilor, după cum explică Centrul Național de Biotehnologie, este să se uite la părțile exterioare ale lanțurilor de polimerază pentru fragmente mari. Aceste fragmente conțin fragmente mici așteptate și pot fi amplificate fără a crea ambiguități. Odată ce fragmentele exterioare sunt amplificate, cele interioare pot fi apoi amplificate cu mult mai puțină contaminare.
