O colonie izolată este o colonie bacteriană care a fost izolată de alți contaminanți, de obicei prin plasarea unui eșantion într-un vas petri steril sau într-un vas de sticlă cu substanțe nutritive. Acest proces asigură că orice observații sau experimente sunt gratuite din afara contaminanților biologici. Această colonie este numită adesea o "cultură pură".
Deoarece cea mai pură cultură este derivată dintr-o singură celulă, biologii pot merge la mari distanțe pentru a crea colonii izolate. Prima cultură este considerată contaminată. Este dispersat pe mediul nutritiv, de multe ori pur și simplu prin împrăștierea acestuia pe un tobogan sau o farfurie. Dacă se face corect, acest lucru asigură faptul că celulele care se împart vor crea mici colonii izolate care pot fi apoi mutate într-un alt diapozitiv ca o cultură pură. O altă metodă pentru crearea culturilor pure implică dizolvarea probelor bacteriene în apă și apoi folosirea unui microscop pentru a localiza o picătură cu o singură bacterie izolată. Această bacterie este apoi aruncată într-o soluție nutritivă cu apă pentru a crea colonia.
Odată ce o colonie izolată a fost dezvoltată, ea poate fi utilizată în mai multe scopuri. În laboratoarele medicale, coloniile izolate sunt adesea folosite pentru a identifica și a diagnostica boala, a examina calitățile unui eșantion de celule canceroase sau a determina ce antibiotice sunt cele mai eficiente în combaterea bacteriei. Laboratoarele genetice utilizează aceste probe pentru a experimenta ADN recombinant sau pentru a căuta gene specifice.