Celulele animale conțin structuri cum ar fi lizozomii și centriolii pe care celulele vegetale nu le fac. Celulele animale sunt, de asemenea, în general mai mici și au mai multă varietate de formă decât celulele vegetale.
Atât celulele animale cât și cele ale plantelor sunt eucariote, ceea ce înseamnă că au un nucleu și organele legate de membrană. Cu toate acestea, celulele animale și de plante au mai multe diferențe în structură care reflectă diferitele lor funcții. Celulele de animale conțin lizozomi, organele care digeră molecule mari. În majoritatea celulelor vegetale, vacuole, mai degrabă decât lizozomii, sunt responsabile pentru ruperea macromoleculelor. Celulele de animale conțin și vacuole, dar, în cazul în care celulele de plante posedă deseori un vacuol mare, cele mai multe celule animale conțin mai multe mici.
În timpul diviziunii celulare, celulele animale se bazează pe centrioli pentru organizare și reglementare, pe măsură ce cromozomii se aliniază până la divizare; celulele de plante nu au aceste organe în formă de cilindru. Deoarece celulele animale nu au peretele celular rigid al celulelor de plante, având doar o membrană celulară flexibilă, ele au mult mai multă diversitate în formă. De asemenea, înseamnă că celulele animale se bazează pe structuri interne pentru sprijinul celular, în loc să câștige sprijinul unui perete celular.
Ambele celule vegetale și animale trebuie să stocheze energie, dar realizează acest lucru în moduri diferite. Celulele de animale utilizează un carbohidrat complex, glicogen, pentru a stoca energia, în timp ce celulele de plante stochează energie sub formă de amidon.