Numărul de cromozomi pe care o maimuță le are depinde de speciile de maimuțe. Maimuța Rhesus are 42 de cromozomi, în timp ce maimuța capucină are 54 de cromozomi, iar maimuța veveriță are 44 de ani. Maimuțele, cum ar fi marmosetul matasos, au 46 de cromozomi, ceea ce reprezintă același număr de cromozomi ca și oamenii.
Toate speciile de mare maimuță au 48 de cromozomi, ceea ce reprezintă o pereche mai mare decât omul. Atât maimuțele, cât și maimuțele mari reproduc sexual, oferindu-le un număr Haploid și Diploid. Numărul Haploid este jumătate din numărul diploid. Este numărul de cromozomi găsiți într-o celulă sexuală sau numărul de perechi de cromozomi. Numărul Diploid este numărul de cromozomi dintr-o celulă care nu este o celulă de ouă sau o celulă de spermă.